生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组开
来源:惩罚网 发表于2019-07-08 23:28:39 编辑:周笔畅
摘要: 2019年4月29日,生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组在《美国科学院院刊》(PNAS)上宣布题为Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing的论文。该

 

生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组开发单细胞全转录组测序新技术

 

生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组开发单细胞全转录组测序新技术

 

生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组开发单细胞全转录组测序新技术

 

生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组开发单细胞全转录组测序新技术

2019年4月29日,生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组在《美国科学院院刊》(PNAS)上宣布题为Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing的论文。该研讨使用微流控芯片技能完成了高质量单细胞的全转录组测序样品预备,全面提高了单细胞全转录组剖析的准确性和可靠性。

细胞是生命活动的基本功能单位,而在生物体内没有任何两个细胞是彻底相同的。传统的生命科学与医学研讨,绝大多数情况下都是针对混合的许多细胞进行的,无法调查到单个细胞之间纤细的不同。近年来不断开展的试验技能,供给了愈加定量与客观的依据,标明在许多要害生命进程例如胚胎发育、细胞分解、疾病发作与开展等进程中,特定的单个细胞行为,以及其间的个别化差异与异质性,导致了极端重要乃至是决定性的成果。而之前根据许多细胞均匀丈量所取得的成果并无法正确反映杂乱生物系统的全面实在信息,严峻掩盖了独立个别样本的行为以及生命现象中许多存在的随机行为。针对单个细胞的研讨,是细胞生命剖析技能所寻求的极限状况,是对传统技能极大的应战。

单细胞测序使用新一代的测序技能来剖析单个细胞内的基因信息,成为解读单细胞的最佳东西。单细胞全转录组测序是单细胞高通量测序需求量最大的使用,它所测定的是单个细胞内一切基因的表达量,一起还能够测定除了mRNA分子外,其他长非编码RNA(lncRNA)以及小RNA的含量,定量获取单个细胞完好的表达谱。现在选用的新一代测序技能中,绝大多数办法都需求特定的前处理进程,制备“测序文库”。而针对单细胞样品,已有的办法均存在许多缺点,导致检测灵敏度不高、基因表达信息丢掉严峻、技能噪音高、操作失误率高、重复性差。

为了处理这一对立,两个课题组合作开发了新的文库制备办法,将最要害的单细胞转录组文库构建进程集成在一个微流控芯片上,能够一起进行多个样品的操作。这一技能的开发,大大减少了试剂用量,在反响功率得到提高的一起极大地按捺了污染的发作,还减少了操作差错,完成了更高的可靠性和更好的平行性。

经过对几十个细胞的剖析标明,这一办法能够有效地消除转录组高度动态特性所带来的丈量差异,完成对单细胞异质性的剖析和判别。经过多个细胞较低深度的转录组测序,能够获取比平等本钱下单个细胞高深度测序更重要的细胞异质性信息,而更好地展现生物系统的杂乱性、随机性和动态进程。而经过微流控芯片上的准确细胞控制和自动抓获进程,还能够脱节其他相似办法中随机抓获的局限性,完成对极端少数细胞的彻底抓获和反响前的表型调查,以更好地了解和验证单个细胞的异质性。与已有的技能比较,这一作业展现了现在最好的单细胞转录组测序检测灵敏度和平行性。

黄岩谊博士一起任北京大学工学院教授,汤富酬博士一起任北京大学生命科学学院研讨员。黄岩谊组博士后Aaron Streets博士、赵亮博士和研讨生张先念为论文的首要作者。这一作业得到了国家科技部973方案、863方案、国家自然科学基金委及霍英东教育基金会的赞助。

黄岩谊课题组主页:http://gene.pku.edu.cn

汤富酬课题组主页:http://biopic.pku.edu.cn/detail.aspx?id=3

Aaron M. Streets, Xiannian Zhang, Chen Cao, Yuhong Pang, Xinglong Wu, Liang Xiong, Lu Yang, Yusi Fu, Liang Zhao, Fuchou Tang, Yanyi Huang. Microfluidic single-cell whole transcriptome sequencing. PNAS, early edition published online (2019)

论文链接:http://www.pnas.org/content/early/2019/04/29/1402030111.abstract

修改:舍予

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